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Un mundo feliz de secuenciación de ADN prenatal
Las pruebas prenatales podrían volverse más seguras e informativas en los próximos años gracias a las tecnologías desarrolladas para examinar el genoma de un feto a partir de la sangre de la madre.
Illumina, el fabricante de máquinas de secuenciación de ADN líder en el mundo, se está moviendo ahora agresivamente hacia el campo de la secuenciación prenatal. A principios de este mes, la empresa Anunciado que compraría startup Verinata , que lanzó su sistema de conteo de cromosomas prenatal la primavera pasada . La adquisición sigue una serie de movimientos de Illumina para aumentar su presencia en el diagnóstico médico prenatal (consulte Compra de líder en secuenciación de ADN en pruebas prenatales).
Los métodos convencionales para comprobar el genoma de un feto en busca de anomalías requieren procedimientos invasivos, como el uso de una aguja para extraer algo de líquido amniótico que rodea al feto o algunas células de la placenta, métodos que a veces pueden provocar un aborto espontáneo.
Estas pruebas se enfocan principalmente en números anormales de ciertos cromosomas (como la condición que causa el síndrome de Down) y se ofrecen solo a mujeres con embarazos de alto riesgo. Pero se podría extraer mucho más del ADN fetal que flota en la sangre de la madre, y algunos creen que estas pruebas pronto estarán disponibles para muchas mujeres.
La primera empresa en ofrecer pruebas de detección prenatal a partir de la sangre de una madre fue Sequenom, que puso a disposición su prueba MaterniT21 en octubre de 2011. El año pasado, los médicos utilizaron la prueba de Sequenom para detectar más de 60,000 embarazos en busca de un número anormal de cromosomas.
Para buscar estos trastornos cromosómicos a partir de las 10 semanas de gestación, las empresas secuencian los fragmentos de ADN que flotan en una muestra de sangre de la madre.
Alrededor del 12 por ciento del ADN de su sangre pertenece a su feto. Las pruebas no distinguen qué secuencias pertenecen a la mamá o al feto. En cambio, los algoritmos de conteo se utilizan para buscar cambios pequeños pero significativos en la cantidad de un cromosoma a otro. Las máquinas de secuenciación de ADN leen cadenas de letras de ADN de unas pocas docenas de pares de bases de largo, y la mezcla de las secuencias de la madre y el bebé se clasifican por cromosomas. Si hay más secuencias de las esperadas pertenecientes a un cromosoma en particular, es probable que el feto lleve una copia adicional.
En una muestra de sangre normal, alrededor del 1,36 por ciento del ADN libre de células debería pertenecer al cromosoma 21, dice Alan Bombard, director médico de Sequenom. Cuando un feto tiene síndrome de Down, la prueba suele encontrar un 1,4 por ciento. Eso no es mucha diferencia, pero lo estás contando 10 millones de veces, dice Bombard.
Los expertos médicos también están tomando nota del floreciente campo. En noviembre, dos sociedades médicas publicaron una opinión conjunta de que las pruebas de ADN no invasivas podrían usarse para detectar embarazos de alto riesgo, que incluyen casos en los que la madre tiene más de 35 años o ha tenido embarazos previos con anomalías cromosómicas (consulte Aprobación de la sociedad médica para prenatales no invasivos Pruebas).
La tecnología puede cambiar toda la medicina prenatal, dice Nancy Rose, genetista clínica que presidió el comité de opinión conjunta. Este es un uso muy temprano de la tecnología y solo mejorará, dice Rose. Aún así, el comité recomienda que las pruebas se ofrezcan solo a mujeres con embarazos de alto riesgo, no a aquellas con situaciones de riesgo promedio o bajo: simplemente no hay datos sobre pacientes de bajo riesgo, dice Rose. No tenemos buena información para brindarles a estas mujeres sin tener grandes ensayos prospectivos. Es una postura razonable ser cauteloso.
Otro motivo de precaución al utilizar las pruebas para embarazos de riesgo bajo o medio es que cualquier indicio de un trastorno cromosómico debería confirmarse con un procedimiento invasivo, como una amniocentesis, que puede provocar un aborto espontáneo. La mayor preocupación de mucha gente es un falso positivo, dice Bombard.
Aun así, Illumina ve un mercado mucho más grande en el futuro. Con estos enfoques no invasivos, eventualmente podremos probar a todos, dice Greg Heath , que gestiona la división de diagnóstico de Illumina. Y algún día, las pruebas podrían detectar una cantidad mucho mayor de trastornos.
Si bien las empresas de pruebas prenatales no invasivas ofrecen actualmente pruebas para detectar errores de cromosomas completos, están mirando hacia un futuro en el que puedan obtener una vista mucho más detallada del genoma fetal y tal vez incluso decirles a los padres si su bebé nonato porta mutaciones genéticas particulares.
Recién estamos comenzando con [números anormales de cinco cromosomas específicos], pero expandiremos esto a trastornos de un solo gen, dice Bombard. Este es solo el primer paso en lo que esperamos sea un largo camino para ayudar a los pacientes, dice.
Illumina y Verinata dicen que también buscarán un análisis genético fetal más refinado. El límite es el costo de la secuenciación, no algo fundamental en el enfoque, dice Rich Rava, director científico de Verinata. Siempre lo hemos visto como una tecnología de genoma completo, dice.
A medida que la secuenciación se vuelve más y más barata, si quisiera observar una mutación en particular, por ejemplo, en el gen de la fibrosis quística, es posible que pueda hacerlo en el futuro, dice Heath.
A medida que llegan los avances técnicos, quedan por abordar las cuestiones éticas. Abordar solo ese gen genera diferentes problemas, dice Heath. Con una secuencia del genoma completo de un feto, ¿cómo manejan las familias el hecho de saber que el feto conlleva un riesgo genético que puede causar problemas solo al final de la vida en comparación con las mutaciones que probablemente causarán una muerte prematura?
Si existe la probabilidad de que un bebé muera dentro de los primeros seis meses de una vida corta y dolorosa, es posible que tome una decisión diferente, dice Heath. Creemos que cualquier elección debería ser una elección informada.