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Genoma de $ 1,000 en dos horas para 2012, dice el CEO de Ion Torrent
El mítico genoma de $ 1,000 está casi sobre nosotros, dijo Jonathan Rothberg, CEO de la compañía de tecnología de secuenciación Ion Torrent, en la conferencia de Tecnología Emergente del MIT. Si su predicción se hace realidad, representará un triunfo asombroso en el rápido desarrollo tecnológico. La velocidad a la que la secuenciación del genoma se ha vuelto más asequible es más rápido que la ley de Moore . (Puede leer una sesión de preguntas y respuestas NIÑOS hizo con Rothberg a principios de este año aquí, y un perfil de su empresa aquí).
Jonathan Rothberg, director de Ion Torrent, hablando en EmTech 2011
Para esta época, el año que viene secuenciando genomas humanos tan rápido y barato como el genoma bacteriano, dijo Rothberg. (Anteriormente, había comentado que su empresa ahora puede hacer un genoma bacteriano completo en aproximadamente dos horas).
Estaba en la sala el 19 de octubre cuando lo dijo, y habría pensado que era pura arrogancia si no fuera por el increíble historial de Rothberg en esta área, desde la fundación de la exitosa empresa de secuenciación de la generación anterior 454 Life Sciences hasta los recientes avances logrados con el La misma tecnología que él propone nos llevará al genoma de $ 1,000.
Esta tecnología, llamada, llamada Máquina de genoma personal , ya se está utilizando para determinar qué mutaciones están presentes en los genomas de los cánceres de los pacientes .
El Personal Genome Maker ya está apareciendo en laboratorios clínicos, incluso en consultorios médicos.
La clave de este avance, dice Rothberg, es que el PGM no se basa en la química húmeda convencional para secuenciar el ADN. En cambio, funciona casi en su totalidad a través de tecnología de microchip convencional , lo que significa que Ion Torrent está aprovechando décadas de inversión en transistores y chips convencionales.
Entonces, ¿cómo es la edad del genoma de $ 1,000? Hasta que sepamos con qué más de esos genes se correlacionan realmente, para la mayoría de nosotros no será tan diferente del presente.
En este momento, no hay muchas correlaciones entre esos 3 mil millones de pares de bases [del genoma humano] y los resultados o medicamentos, dice Rothberg. Él predice que se necesitarán al menos 10 años de experimentos clínicos con secuenciación completa del genoma para llegar al punto en que podamos comenzar a desbloquear su valor.
Y pasarán 20 años antes de que entendamos el cáncer al mismo nivel que el VIH y podamos encontrar combinaciones de medicamentos [adaptados] para cada individuo, dice Rothberg.
Puede ver un video completo de su charla en el sitio EmTech de Tech Review.