El motor de búsqueda de enfermedades raras que supera a Google

A fines de la década de 1940, un profesor de la Facultad de Medicina de la Universidad de Maryland acuñó una frase inusual para describir diagnósticos inesperados. Cuando escuche los cascos detrás de usted, no espere ver una cebra, dijo. La frase se atascó y hoy en día, los médicos comúnmente usan el término cebra para describir una enfermedad rara, generalmente definida como una que ocurre en menos de 1 de cada 2000 de la población.

Las enfermedades raras son intrínsecamente difíciles de diagnosticar. Según la Organización Europea de Enfermedades Raras, el 25 por ciento de los diagnósticos se retrasan entre 5 y 30 años.

Por lo tanto, no es de extrañar que los médicos estén buscando formas más efectivas de hacer su trabajo. Una ayuda cada vez más común en este proceso es el motor de búsqueda, generalmente Google. Esto forma parte de un proceso iterativo en el que un médico ingresa síntomas en un motor de búsqueda, examina listas de enfermedades potenciales y luego busca más evidencia de síntomas en el paciente.

El problema, por supuesto, es que los motores de búsqueda comunes o ajenos no están optimizados para este proceso. Google, por ejemplo, considera que las páginas son importantes si están vinculadas a otras páginas importantes, la base de su famoso algoritmo PageRank. Sin embargo, es poco probable que las enfermedades raras, por definición, tengan un perfil alto en la web. Es más, es probable que las búsquedas estén plagadas de resultados de todo tipo de fuentes irrelevantes.

Hoy, Radu Dragusin de la Universidad Técnica de Dinamarca y algunos amigos presentan una alternativa. Estos chicos han creado un motor de búsqueda a medida dedicado al diagnóstico de enfermedades raras llamado FindZebra , un nombre basado en la jerga médica común para una enfermedad rara. Después de comparar los resultados de este motor con las mismas búsquedas en Google, muestran que es significativamente mejor para devolver resultados relevantes.

La salsa mágica en FindZebra es el índice que utiliza para buscar resultados. Estos chicos han creado este índice rastreando un conjunto especialmente seleccionado de bases de datos seleccionadas sobre enfermedades raras. Estos incluyen el Herencia mendeliana en línea en el hombre base de datos, la Centro de información sobre enfermedades genéticas y raras y Orphanet .

Luego utilizan la herramienta de recuperación de información de código abierto Indri para buscar en este índice a través de un sitio web con una interfaz de motor de búsqueda convencional. El resultado es FindZebra.

Finalmente, compararon los resultados de las búsquedas en FindZebra con la misma búsqueda en Google aplicada al mismo conjunto de datos limitado, una característica que es posible con las búsquedas avanzadas de Google. Dragusin y compañía dicen que los resultados de Google son significativamente peores que los suyos.

Por ejemplo, en FindZebra, la consulta de búsqueda Niño, nacimiento normal, deformidad de ambos dedos gordos del pie (articulación faltante), desarrollo rápido de tumor óseo cerca de la columna vertebral y osteogénesis en la biopsia devuelve el diagnóstico correcto Fibrodisplasia osificante progresiva como primer resultado. Sin embargo, este diagnóstico no aparece en absoluto en los resultados de ningún tipo de búsqueda en Google.

Esto indica que el algoritmo de PageRank, o al menos la forma en que Google lo ha modificado, no es adecuado para este tipo de búsqueda. Nuestro hallazgo, que FindZebra supera a Google en general para esta tarea y especialmente cuando está restringido a los sitios de nuestra colección (Google Restricted), sugiere que el algoritmo de clasificación de Google es subóptimo para la tarea en cuestión, concluyen.

Aunque todavía es un proyecto de investigación, Dragusin y compañía han puesto a disposición del público su motor de búsqueda de enfermedades raras en www.findzebra.com . Esto claramente podría convertirse en una herramienta valiosa para la comunidad médica.

Sin embargo, lo que está menos claro es cómo utilizará esta herramienta el público en general. El sitio viene con el mensaje de tristeza: ¡Advertencia! FindZebra es un proyecto de investigación y se utilizará solo por profesionales médicos.

FindZebra obviamente podría ser un estatuto de hipocondríaco. Por otro lado, eso es cierto para cualquier diccionario médico.

El público informado visita cada vez más a sus médicos armado con información detallada descargada de Internet. Cualquier movimiento para mejorar la calidad de esta información debe ser sin duda de gran valor.

Ref: arxiv.org/abs/1303.3229 : FindZebra: un motor de búsqueda de enfermedades raras

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