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El gobierno británico elige a Illumina para secuenciar 100.000 genomas
El gobierno británico dice que planea contratar a la empresa estadounidense de secuenciación de genes Illumina para secuenciar 100.000 genomas humanos en lo que es el proyecto nacional más grande para decodificar el ADN de una población.
Máquina de genes: Un instrumento de secuenciación de Illumina puede decodificar un genoma en un día.
En una presentación reglamentaria con la Comisión de Bolsa y Valores de EE. UU., Illumina dijo que había sido elegido como socio preferido para el proyecto de £ 100 millones.
Genomics England confirmó que había elegido a la empresa de California para llevar a cabo el proyecto de secuenciación. Hemos pasado por el proceso de 'horneado' para encontrar la empresa adecuada para realizar la secuenciación, y ahora entraremos en negociaciones detalladas, dice Vivienne Parry, portavoz de Genomics England.
Los instrumentos de secuenciación de Illumina dominan el mercado para desentrañar el ADN (consulte 50 empresas más inteligentes). Parry dice que menos de otras cinco empresas pujaron por el trabajo, uno de los proyectos de secuenciación más grandes jamás emprendidos.
Algunos otros países también están considerando grandes proyectos nacionales de secuenciación. El proyecto del Reino Unido se centrará en personas con cáncer, así como en adultos y niños con enfermedades raras. Debido a que todos los británicos son miembros del Servicio Nacional de Salud, el proyecto espera poder comparar datos de ADN con registros de salud centralizados detallados (ver Por qué el Reino Unido quiere un Servicio Nacional de Salud Genómico).
Si bien el número de genomas a secuenciar es 100.000, el número total de británicos que participan en el estudio es menor, alrededor de 70.000. Esto se debe a que, para los pacientes con cáncer, Genomics England tiene la intención de obtener la secuencia tanto de su ADN heredado como del de sus cánceres.
Genomics England comenzó a hablar a principios de este año con posibles postores, incluida la empresa china y rival de Illumina, BGI (consulte Inside China's Genome Factory). En ese momento, el costo promedio de completar un genoma era de alrededor de $ 3,000 a $ 4,000.
Completar los 100.000 genomas habría costado más del doble del presupuesto de Genomics England. La agencia dijo en diciembre que tenía la intención de usar su poder de negociación para bajar los precios.
Illumina reaccionó lanzando un nuevo sistema, el Hiseq X Ten, que dice que podría secuenciar genomas por $ 1,000 cada uno, cruzando una barrera de precios largamente anticipada (ver ¿Tiene Illumina el primer genoma de $ 1,000?).
Ese sistema es en realidad 10 máquinas, cada una con un costo de $ 1 millón. Al exigir a los compradores que invirtieran al menos $ 10 millones en equipos, Illumina se aseguró de que los costos más bajos de su nuevo sistema no afectaran ampliamente los precios en otras partes del mercado de secuenciación, al tiempo que le permitía capturar grandes empleos nacionales como el del Reino Unido.
Según los usuarios del nuevo sistema Illumina, el precio por genoma aún se acerca más a los $ 2,000 que a los $ 1,000.
Parry dice que Illumina llevará a cabo la secuenciación en nombre de Genomics England y que los dos finalizarán las negociaciones durante las próximas dos semanas. Es un proyecto tremendamente emocionante que está a la vanguardia de la tecnología. No es algo que la gente haya hecho antes, dice Parry. Estaremos en los límites de la tecnología.
[Actualización 12/7/14: Illumina llevará a cabo la secuenciación en nombre de Genomics England de 100.000 genomas. Una versión anterior de este artículo decía incorrectamente que Genomics England tenía la intención de secuenciar el ADN de 100.000 individuos distintos y que lo haría él mismo con instrumentos comprados a Illumina.]