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Con demanda de patentes, Illumina busca domar al emergente rival británico Oxford Nanopore
El gigante de secuenciación de genes Illumina es como el aceite estándar de la era del genoma. Excepto que en lugar de aceite bombea ADN.
Más del 90 por ciento de todos los datos de ADN son generados por máquinas que vende Illumina, y la compañía de San Diego quiere que siga siendo así.
Eso explica por qué Illumina dijo hoy que intentaría bloquear las ventas comerciales de un nuevo instrumento disruptivo de secuenciación de ADN desarrollado por un rival británico de altos vuelos, Oxford Nanopore.
En una demanda de patentes y una queja por separado ante la Comisión de Comercio Internacional de EE. UU., Illumina dijo que los dispositivos de secuenciación de ADN de última generación de la compañía británica contienen ideas robadas y deben detenerse en los muelles.
A partir de 2014, Oxford comenzó a comercializar un nuevo tipo de secuenciador de ADN de nanoporos que analiza el ADN atrayendo las moléculas a través de un poro diminuto y delicado (ver Radical New DNA Sequencer finalmente llega a las manos de los investigadores). Cada combinación de las letras genéticas A, G, C, T produce un cambio en la corriente eléctrica a medida que avanza, lo que permite leer la molécula.
Illumina dice que controla la patente sobre el poro que usa Oxford, algo que Oxford niega. Pero la batalla más grande es sobre las plataformas tecnológicas y si la secuenciación de nanoporos puede o no desplazar a las máquinas de Illumina.
Los instrumentos del tamaño de un frigorífico de Illumina son rápidos y precisos (consulte Por qué Illumina es el número uno). Pero debido a que funciona de manera diferente, el MinION de Oxford, como se llama el dispositivo, es lo suficientemente pequeño como para ser portátil (es del tamaño de un teléfono celular) y lee tramos muy largos de ADN.
Un secuenciador de ADN nanopore vendido por Oxford Nanopore funciona con una conexión USB.
Aunque es más lenta y menos precisa que los instrumentos de Illumina, la tecnología de nanoporos amenaza con convertirse en un competidor a medida que los científicos encuentran aplicaciones completamente nuevas para ella. como la secuenciación del virus del Ébola y el diagnóstico de pacientes en un laboratorio improvisado en Guinea .
En su blog, Mick Watson, un investigador genético de la Universidad de Edimburgo que usa ambas tecnologías, llamó a las demandas increíblemente decepcionante y dijo que para los investigadores era como tener a dos de tus amigos peleando.
De hecho, las dos compañías han estado peleando desde 2012 después de rompiendo planes desarrollar conjuntamente un instrumento de nanoporos y convertirse en rivales.
En un comunicado, el director ejecutivo de Oxford Nanopore, Gordon Sanghera, dijo que las demandas no tenían fundamento. Bromeó diciendo que es gratificante que el monopolista del mercado reconozca públicamente la relevancia comercial de los productos Oxford Nanopore.
Oxford no ha informado ninguna cifra de ventas, pero la compañía ha dicho que más de 1000 equipos científicos están utilizando el MinION.
oxford es clasificado La empresa de tecnología de rápido crecimiento más emocionante y valiosa de Gran Bretaña. Ya vale alrededor de 970 millones de libras, o $ 1.4 mil millones, y es planeando una salida a bolsa , de acuerdo con la tiempo de domingo .
Hasta ahora, los dispositivos de Oxford representan una porción del mercado de máquinas de secuenciación rápida, productos químicos y software, que tiene un valor de $ 3 mil millones a $ 4 mil millones al año, según Shawn Baker, cofundador de AllSeq, una consultoría de genómica.
Debido a que Oxford aún no tiene una gran presencia comercial, dice Baker, la demanda de Illumina se trata de proteger su espacio y causar dolores de cabeza a Oxford mientras intentan cotizar en bolsa.
Illumina ha defendido agresivamente su territorio, utilizando hábilmente recortes de precios, juicios y adquisiciones para mantener su posición en el mercado. En 2012 incluso abrió fuego contra uno de sus mayores clientes , la operación de investigación china BGI , después de que esa organización adquiriera una tecnología competidora.
Las bacterias usan naturalmente los poros de proteínas para mover los nutrientes a sus cuerpos celulares. Pero los poros son muy delicados, y Oxford tardó 10 años en aprender a fusionarlos en un dispositivo físico que pudiera leer el ADN.
Oxford nunca ha revelado públicamente qué poro hay dentro de sus máquinas; la compañía dice que es un secreto comercial. Pero según las demandas de Illumina, es más probable que MinION utilice un poro desarrollado por Jens Gundlach, físico de la Universidad de Washington y colaboradores de la Universidad de Alabama.
Hasta el trabajo de Gundlach, publicado a partir de 2010 y posteriormente autorizado por Illumina, la secuenciación de nanoporos se vio obstaculizada por problemas técnicos. Pero Gundlach descubrió que un poro en forma de embudo de la bacteria Mycobacterium smegmatis (llamado así porque se encuentra en las secreciones genitales) produjo una señal aproximadamente 10 veces más fuerte que los poros anteriores, según la demanda de patente de Illumina, a la que se unieron ambas universidades.
En su demanda, Illumina dice que muchas líneas de evidencia sugieren que Oxford está usando versiones mejoradas de ese poro en el MinION.
Al pedir a los funcionarios de comercio de EE. UU. que investiguen a Oxford y posiblemente prohíban las importaciones del MinION a EE. UU., Illumina podría enojar a los investigadores, ya que no hay tecnología comparable disponible. Illumina nunca ha anunciado planes para vender un producto de nanoporos propio.
Los abogados de Illumina, Fish & Richardson en Washington, D.C., señalaron que el público en general no se vería perjudicado si el MinION fuera detenido en la aduana y se le prohibiera ingresar a los EE. UU. Illumina puede llenar cualquier vacío con sus propios productos, dicen.