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Bacterias de la yema del dedo: una herramienta forense prometedora
No son solo nuestros genomas los que nos hacen únicos. El perfil genómico de las bacterias que se frotan en las yemas de nuestros dedos y en los objetos que tocamos (un teclado de computadora, por ejemplo) también proporciona una huella digital que podría usarse con fines forenses, según investigadores de la Universidad de Colorado en Boulder.
Noah Fierer , Rob Knight , y sus colegas recuperaron bacterias de los teclados de tres individuos y secuenciaron una gran cantidad de genomas bacterianos a la vez.
Los investigadores extrajeron ADN bacteriano de numerosas muestras tomadas de los tres teclados y secuenciaron más de 1.400 copias del gen ribosómico bacteriano de cada muestra para identificar las especies individuales de bacterias que contenía cada muestra, y descubrieron que podían hacer coincidir los tres individuos con los teclados que usaban. Luego tomaron hisopos de ratones de computadora de nueve personas diferentes. Cuando compararon las bacterias encontradas en las muestras con una base de datos de comunidades microbianas encontradas en 270 manos de personas que nunca habían tocado ninguno de los ratones de la computadora, los investigadores encontraron que las bacterias en el ratón de cada persona eran más similares a las de sus manos que a las muestras en la base de datos. Hasta ahora, señala Fierer, la técnica es extremadamente preliminar, pero algún día podría ser tan precisa como técnicas como el análisis de ADN o huellas dactilares, dice.
La idea de usar una firma microbiana para identificar individuos no es nueva, dice David Relman , profesor de medicina y de microbiología e inmunología en la Universidad de Stanford. Durante décadas, los investigadores se han preguntado si sería posible identificar a los individuos basándose, por ejemplo, en las cepas únicas de Escherichia coli albergado en sus entrañas. Sin embargo, hasta hace poco tiempo, todas las ideas que estaban flotando no se podían explorar de una manera realmente detallada y metódica, dice Relman.
En los últimos años, la tecnología de secuenciación más rápida y barata ha allanado el camino para estudios exhaustivos de las diversas comunidades microbianas albergadas en el cuerpo humano, y los investigadores han ideado códigos de barras de ADN (hebras cortas de ADN característico) que les permiten identificar especies fácilmente. de bacterias.
No se podía hacer esto literalmente hace tres años, dice Precio de Lance , director del Centro de Metagenómica y Salud Humana del Instituto de Investigación de Genómica Traslacional en Arizona.
Un puñado de estudios recientes dentro del Proyecto de microbioma humano , incluido uno de los mismos investigadores, han demostrado que la composición de los microbios en la piel de diferentes individuos, e incluso los que se encuentran en diferentes partes del cuerpo de la misma persona, varía constantemente. El estudio actual muestra que incluso los residuos de microbiota que quedan retienen las características de la individualidad, dice Relman. Como técnica forense, señala, es demasiado pronto para su aplicación, pero algún día podría volverse sólida.
El enfoque, cuando se desarrolle de manera más completa, podría potencialmente proporcionar información donde las técnicas forenses existentes se quedan cortas, dice Martin Blaser , profesor de medicina y microbiología en la Universidad de Nueva York. Cuando simplemente se limpia la piel, se obtiene al menos 100 veces más ADN microbiano que ADN humano, dice, por lo que menos material podría dar a los investigadores una señal más fuerte.
Blaser también señala que las huellas dactilares no se pueden leer con precisión si están manchadas, mientras que una impresión manchada aún podría contener suficientes microbios para analizar. El microbioma somos nosotros, es solo otra forma de huella digital, al igual que el ADN genómico somos nosotros, dice Blaser, quien escribió un comentario adjunto al estudio, ambos publicados en Actas de la Academia Nacional de Ciencias .
Sin embargo, hasta ahora, quedan muchas preguntas sobre qué tan precisa puede llegar a ser la técnica. Hicimos estos estudios como prueba de concepto, dice Fierer. Ahora tenemos que hacer el trabajo duro.
Por un lado, no está claro si la firma microbiana de un individuo podría recuperarse si otra persona ha tocado el objeto que se está muestreando. Otra pregunta abierta es qué tan estable es realmente el microbioma de un individuo. Los antibióticos, por ejemplo, cambian el perfil bacteriano de un individuo, aunque nadie sabe durante cuánto tiempo. Un paso clave para desarrollar el nivel de confianza necesario, dice Fierer, será ampliar la base de datos de las comunidades microbianas que se encuentran en las manos de los individuos. Ser capaz de comparar un perfil con una gran cantidad de otros perfiles proporcionará una línea de base para extraer los elementos verdaderamente individuales.
Sin embargo, dice Relman, la misma razón que lo hace más complejo le da todo tipo de valor que el ADN nunca tendrá. Por ejemplo, dice, la microbiota de una persona puede revelar no solo su identidad, sino que también puede dar pistas sobre lo que esa persona tiende a comer, por ejemplo, o dónde trabaja o vive, para que los investigadores puedan determinar cómo los tipos de microbios que se encuentran en el cuerpo dependen de tales factores.
Creo que este es el comienzo del proceso, dice Relman. Pero vamos a necesitar muchas más fuentes de variación antes de que podamos ver al individuo brillando.